Comment traquer un microbe qui manque
d'appétit
(ASP) - Les tests visant à détecter
des microbes dans l'eau ne fonctionnent pas à tous
les coups. Une équipe du Centre de recherche de
l’Hôpital Laval, à Québec, affirme
avoir utilisé une méthode qui a détecté
un microbe furtif en quelques heures seulement, plus de
deux fois et demi plus souvent qu'avec la méthode
traditionnelle.
La méthode traditionnelle utilisée
par les microbiologistes, c'est la technique de la culture
sur milieu nutritif. Cela consiste littéralement
à mettre l’échantillon d'eau en présence
d’un garde-manger. Si le microbe est bel et bien
là, il va se multiplier et devenir détectable.
Ce procédé permet aussi de donner une idée
d’ensemble de la qualité bactériologique
d’une eau.
Le problème est que certains micro-organismes
pathogènes réagissent peu ou ne réagissent
pas à l’opportunité qu’on leur
donne de se nourrir et de proliférer. En conséquence,
ils ne sont pas détectés.
Ainsi, le chercheur Steve Dutil et sa superviseure
de recherche Caroline Duchaîne, du Département
de biochimie et de microbiologie de l’Université
Laval, soupçonnaient notamment des bactéries
à l’origine de la maladie du légionnaire,
une grave maladie du système respiratoire, de pouvoir
résider en très faible concentration dans
l’eau plus ou moins stagnante de certains tuyaux,
par exemple la tubulure des chaises de cabinets de dentistes.
Voilà pourquoi l’équipe
de recherche a voulu tester cette autre méthode
de détection, moins courante : l’hybridation
in situ en fluorescence (HISF).
Il faut se rappeler que les variétés
de microbes à l’origine de diverses maladies
peuvent être différenciées les unes
des autres en comparant, sur leurs grosses molécules
d’acide ribonucléique ribosomal (ARNr), l’enchaînement
de molécules plus petites. Pour savoir si un milieu
est colonisé par un certain microbe, on y cherchera
donc des segments de la molécule d’ARNr du
suspect.
Mais comment savoir si les segments en question
sont bien ceux que l'on recherche, soit ceux du microbe
suspect ? Par l’hybridation. L'hybridation, dans
ce contexte, c’est comme l’envoi, dans un échantillon
d’eau, d’une " serrure "
biochimique du microbe, à la recherche de sa "
clef " secrète, clef qui se trouve à
l'intérieur même de la cellule du microbe,
d’où le terme " in situ ".
Une imbrication parfaite des molécules produira
une fluorescence observable au microscope après
quelques manipulations.
Loin du tube digestif et de l’épiderme
humains –qu’affectionnent plusieurs microbes–
il reste quantité d’autres micro-organismes
méconnus. Le recours accru à l’HISF
en facilitera l’étude.
Pierre Croteau
