Comment occuper les scientifiques pendant un
siècle
(ASP) - On vous parle depuis plusieurs
mois de la carte des protéines, qui va un jour
succéder à la carte des gènes.
En voici une première ébauche. Pour la
première fois, une recherche vient de déterminer
le "quota" de protéines d'un être
vivant.
Si 2001 a été l'année
du génome, 2002 pourrait bien être celle
du protéome -un nouveau mot auquel il faudra
décidément s'habituer- commente la revue
Nature. Ou de la protéomique: alors que
la génomique consiste en l'étude de l'ensemble
de la carte de nos gènes, la protéomique
consiste en l'étude de l'ensemble de la carte
de nos protéines.
Et une carte bien spéciale ce sera:
car si un gène reste immuablement à la
même place, une protéine peut tantôt
être là, tantôt ailleurs. Tantôt
active, tantôt inactive. Un gène peut produire
plus d'une protéine, plusieurs gènes peuvent
n'en produire aucune. Et chaque protéine peut
interagir avec une ou plusieurs autres. La tâche
est donc colossale, plus colossale encore que celle
de la carte des gènes.
L'équipe internationale qui publie
dans
Nature s'est attaquée à un
micro-organisme: la levure de bière. Elle a identifié
ses 6000 protéines. Et la première surprise
a été le grand nombre de ces protéines
(85%) qui interagissent avec d'autres. L'une d'elles
avait des liens avec pas moins de 96 de ses semblables.
"C'était une grande surprise de voir à
quel point ces protéines sont sociales", ironise
Giuilo Superti-Furga, du Laboratoire européen
de biologie moléculaire à Heidelberg,
en Allemagne.
Mais cela donne du même coup une
idée de l'immensité du travail qui attend
ces chercheurs. "Ca défie l'imagination", résume
Mike Tyers, de l'hôpital Mont Sinaï, à
Toronto. Car de ces interactions entre les protéines
dépend tout le reste: si on veut un jour concevoir
un médicament dont le but serait de bloquer l'action
d'une protéine néfaste, on a intérêt
à connaître toutes les interactions de
cette protéine avec ses consoeurs, et tous les
rôles que cette protéine peut jouer, dans
diverses situations.
Autant dire que cette première
"carte" ne fait qu'offrir un embryon de réponse,
et que plusieurs autres cartes sont à venir,
dans les prochaines années... et décennies.