Depuis février 2006, les chercheurs constatent un déclin accéléré de certaines populations et découvrent un nombre anormal de morts dans les cavernes où hibernent ces bestioles, en particulier dans l’État de New York et en Pennsylvanie. On le connaît au Québec sous le nom de « syndrome du museau blanc », parce qu’il s’agit d’une maladie qui se développe dans le museau et affecte les voies respiratoires. On soupçonne un champignon parasite, mais sa cause et son mode de transmission restent inconnus.