Pour Mathole Motshekga, juriste de formation et haut placé dans la hiérarchie du parti au pouvoir, l’ANC, la découverte de l’Homo naledi renvoie à cette « pseudoscience » du monde occidental qui prétend que « les Africains descendent des babouins ». Puisque l’humanité, poursuit-il, « préexiste l’Univers », l’Homo naledi « ne colle donc pas à la réalité ». Le président sud-africain Jacob Zuma a pour sa part salué la découverte en déclarant qu’elle faisait de son pays « le berceau de l’humanité ».