Le wiki, dont la manifestation la plus connue est la célèbre encyclopédie libre Wikipédia, est un peu comme une toile d’araignée qui relie les informations entre elles. Il permet donc à l’utilisateur de naviguer (avec plus ou moins d’aisance, selon le cas) sur cette infrastructure aux multiples ramifications.
Abonnez-vous à notre infolettre!
Pour ne rien rater de l'actualité scientifique et tout savoir sur nos efforts pour lutter contre les fausses nouvelles et la désinformation!
De Wikipédia à Ecoliwiki (un wiki entièrement consacré à... la bactérie E. coli!), il y a certes une marge, mais le principe de base demeure le même : quiconque possède des informations pertinentes (moyennant une inscription) peut contribuer à mettre un peu d’ordre dans cette surabondance d’information.
Que nous offre ecoliwiki.net ? Beaucoup de choses. En premier lieu, on peut rechercher soi-même son gène préféré, ce qui nous amène au premier écueil du site : la nomenclature. Cette dernière n’est pas familière, mais plutôt ultra-spécialisée, basée sur les normes du HGNC (Human Genome Organisation Gene Nomenclature Committee). Déjà, on se rend compte que le site n’est pas destiné à un large public.
Cependant, cette situation est contrebalancée par la «quickview», qui est la première fenêtre à laquelle on a accès après avoir entré le nom du gène. Il s’agit d’un aperçu des informations de base sur le gène. Cette façon de procéder a l’avantage de ne pas décourager le néophyte d’E.coli. Si toutefois vous êtes au post-doctorat, alors vous pouvez vous en donner à cœur joie. Au menu : tout ce qui a été répertorié à ce jour sur le gène en question !
Ça peut être long, car son ADN comprend 4,6 millions de paires de bases et code environ 4200 protéines!
L’initiative wiki est donc une avenue prometteuse pour la gestion de ce type d’information scientifique, mais ce système n’est pas parfait. En effet, le wiki doit également faire face à un défi de taille : concilier le principe voulant que tous les auteurs soient tous égaux avec l'ego de ces mêmes auteurs. Ce n’est pas un problème pour le wiki consacré à E.coli, mais c’est une autre histoire pour comme Wikigenes.
En effet, sur ce dernier, pratiquement chaque bribe d’information est associé à son auteur. De plus, les membres peuvent leur attribuer une cote (de une à cinq étoiles).
Les créateurs rétorqueront que le fait d’évaluer les auteurs rend wikigenes plus crédible. Or, selon ce qu’a déjà dit le co-fondateur de Wikipédia Larry Sanger, le principe du wiki stipule qu’aucun auteur n’est supérieur aux autres, qu’il n’y a pas de droits de propriété sur un article, bref, qu’on évite de s’enfoncer dans le prestige associé à une publication scientifique traditionnelle. Comment la communauté scientifique résoudra-t-elle ce dilemme?
David Massé
Sept wikis en génétique: EcoliWiki Gene Wiki PDBWiki Proteopedia TopSan WikiGenes WikiPathways
